Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pcgf6Q99NA9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcgf6Q99NA9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms