Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Brms1Q99N20 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brms1Q99N20 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms