Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrapQ99MP8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms