Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PccbQ99MN9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PccbQ99MN9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms