Protein–RNA interactions for Protein: Q99MI1

Erc1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erc1Q99MI1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erc1Q99MI1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erc1Q99MI1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erc1Q99MI1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms