Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rwdd2bQ99M03 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rwdd2bQ99M03 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms