Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp16Q99LG0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp16Q99LG0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms