Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arrdc1Q99KN1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms