Protein–RNA interactions for Protein: Q924X6

Lrp8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp8Q924X6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp8Q924X6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp8Q924X6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp8Q924X6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms