Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss28Q924N9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prss28Q924N9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prss28Q924N9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms