Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b5Q923D4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms