Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nrif1Q923B3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nrif1Q923B3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrif1Q923B3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms