Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Clip1Q922J3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms