Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubb6Q922F4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb6Q922F4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms