Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Sh3bp4Q921I6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Sh3bp4Q921I6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp4Q921I6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp4Q921I6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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