Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm2Q91YD4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm2Q91YD4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm2Q91YD4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms