Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcdha12Q91Y18 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdha12Q91Y18 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms