Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp3Q91W36 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms