Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mark1Q8VHJ5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mark1Q8VHJ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.9 ms