Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdd2Q8VEK2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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