Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SnrkQ8VDU5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnrkQ8VDU5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms