Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms