Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BbxQ8VBW5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms