Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1mtQ8R4U6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top1mtQ8R4U6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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