Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy2Q8R4C2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy2Q8R4C2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms