Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc12Q8R344 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc12Q8R344 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc12Q8R344 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms