Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c5Q8R2T8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c5Q8R2T8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms