Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OptnQ8K3K8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms