Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssh3Q8K330 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms