Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms