Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1eQ8K202 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms