Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh3Q8K1E6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh3Q8K1E6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms