Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34c1Q8K193 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms