Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf3Q8CIN6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf3Q8CIN6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms