Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc43a2Q8CGA3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc43a2Q8CGA3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms