Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hpf1Q8CFE2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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