Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc38Q8CDN8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc38Q8CDN8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc38Q8CDN8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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