Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf20l1Q8CCJ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf20l1Q8CCJ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms