Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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