Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nhsl1Q8CAF4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nhsl1Q8CAF4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nhsl1Q8CAF4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nhsl1Q8CAF4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nhsl1Q8CAF4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nhsl1Q8CAF4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nhsl1Q8CAF4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nhsl1Q8CAF4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nhsl1Q8CAF4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms