Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Spef2Q8C9J3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Spef2Q8C9J3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms