Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9949Q8C9F4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9949Q8C9F4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9949Q8C9F4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9949Q8C9F4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9949Q8C9F4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9949Q8C9F4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9949Q8C9F4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9949Q8C9F4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms