Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsr2Q8C8T8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsr2Q8C8T8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr2Q8C8T8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms