Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930572O03RikQ8C5Y0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930572O03RikQ8C5Y0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930572O03RikQ8C5Y0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930572O03RikQ8C5Y0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930572O03RikQ8C5Y0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930572O03RikQ8C5Y0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms