Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Ccdc113Q8C5T8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Ccdc113Q8C5T8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Ccdc113Q8C5T8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc113Q8C5T8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc113Q8C5T8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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