Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TiparpQ8C1B2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TiparpQ8C1B2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms