Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Camsap2Q8C1B1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Camsap2Q8C1B1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Camsap2Q8C1B1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 534 ms