Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim47Q8C0E3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms