Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkrfQ8BY02 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkrfQ8BY02 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms