Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn17Q8BXA6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms